Antyzmotyczny oligonukleotyd czynnika XI w zapobieganiu zakrzepicy zylnej AD 5

Przyczyna tego odcięcia została oparta na obserwacjach klinicznych i eksperymentalnych.3,6,7 Populacja bezpieczeństwa obejmowała wszystkich pacjentów, którzy otrzymali co najmniej jedną dawkę badanego leku. Zmodyfikowana populacja przeznaczona do leczenia obejmowała wszystkich pacjentów w populacji bezpieczeństwa, którzy mogliby być oceniani pod kątem pierwotnego wyniku skuteczności. Populacja obejmująca cały protokół obejmowała wszystkich pacjentów w zmodyfikowanej populacji, która miała zamiar leczyć, z wyjątkiem pacjentów z poważnymi naruszeniami protokołu (Figura 2).
W pierwotnej analizie skuteczności sprawdzono hipotezę, że FXI-ASO nie będzie mniejszy niż enoksaparyna wśród pacjentów w populacji z protokołem, u których średnie wartości współczynnika XI wynoszą 0,2 jednostki na mililitr lub mniej między 36 a 39 dniem leczenia; analiza obejmowała wszystkie zdarzenia do 12 dni po operacji. Continue reading „Antyzmotyczny oligonukleotyd czynnika XI w zapobieganiu zakrzepicy zylnej AD 5”

Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 czesc 4

Skuteczność szczepionki zależnej od hazardu została oszacowana za pomocą specyficznych dla przyczyny modeli Cox podzielonych na straty według miejsca badania, z wykorzystaniem testów punktowych w celu określenia niezerowej skuteczności szczepionki i testów Walda dla efektów sita.37 Metody analizy wybrano tak, aby były blisko z te używane do oceny ogólnej skuteczności szczepionki w oryginalnych opublikowanych analizach. 4-7 Dla punktu końcowego dla pasożytów posłużono się metodami analizy podobnymi do metod stosowanych do łącznej analizy skuteczności szczepionki w pierwotnym klinicznym punkcie końcowym malarii. Wielu uczestników miało złożone infekcje wywołane malarią poprzez liczne genotypy założyciela pasożyta. W konsekwencji, przeprowadzono analizy sit na zestawach danych składających się z jednego haplotypu założyciela losowo wybranego od każdego uczestnika, z wielokrotną produkcją 38 używaną do agregowania wyników (szczegóły są dostarczone w planie analizy statystycznej). Przeprowadziliśmy także analizy sitowe na zbiorach danych, w których uczestnicy zarażeni pasożytami jednego lub więcej haplotypów założycieli zostali sklasyfikowani jako pasujący do 3D7 lub nie pasujący do 3D7.
Oprócz badania wcześniej opisanych epitopów Th2R i Th3R, 23 analizowaliśmy częstotliwości haplotypów w uprzednio niezdefiniowanym regionie genomowym, który określamy jako DV10 (reprezentujący 10 pozycji aminokwasowych, od 293 do 302, ograniczony przez aminokwasy asparaginian [D] i walinę [ V]) i haplotypu sprzężeniowego (LD) w oparciu o 6 pozycji (314, 317, 352, 354, 356 i 357), które okazały się wykazywać LD (które ocenialiśmy dla miejsc z mniejszym allelem o co najmniej 3% i r2 co najmniej 0,1) z dwoma lub więcej innymi pozycjami w pięciu największych ośrodkach badawczych (rys. S9 w Dodatku uzupełniającym). Continue reading „Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 czesc 4”

Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 cd

Analizy obejmowały dane MiSeq dla 4421 próbek C w końcowych białkach circumsporozoite i 4499 próbek SERA-2 oraz danych PacBio dla próbek NANP-NVDP z 3137 circumsporozoite (tabele od S1 do S4 i plan analizy statystycznej w dodatkowym dodatku). Wszystkie dane sekwencji amplikonu MiSeq i PacBio zostały przesłane do NCBI Sequence Read Archive35 (BioProject PRJNA235895). Przestudiuj badanie
Próba była sponsorowana przez GlaxoSmithKline Biologicals, twórcę i producenta szczepionki, i była finansowana zarówno przez GlaxoSmithKline Biologicals, jak i przez Inicjatywę Szczepień PATH, która otrzymała grant od fundacji Billa i Melindy Gates. Kilku autorów akademickich, we współpracy z czterema autorami, którzy są zatrudnieni przez GlaxoSmithKline Biologicals, zaprojektowało studium i plan analizy. Kilku autorów akademickich zebrało dane, napisało manuskrypt i ręczy za dokładność i prawdziwość zgłaszanych danych, a pierwsi i ostatni autorzy podjęli decyzję o przesłaniu rękopisu do publikacji. GlaxoSmithKline Biologicals dokonał przeglądu rękopisu przed jego przesłaniem do publikacji. Dodatkowe szczegóły dotyczące składek autorskich znajdują się w dodatkowym dodatku. Continue reading „Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 cd”

Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 ad

Dowody na naturalnie nabytą allelospecyficzną ochronę immunologiczną obserwowano dla antygenu powierzchniowego białka merozoitu (ale nie dla białka circumsporozoit 28) w prospektywnym badaniu kohortowym, a ochronę specyficzną dla allelu opisano w próbie terenowej szczepionki opartej na błonie apikalnej. antygen 1.29 Poprzednie analizy genetyczne próbek pasożytniczych z trzech różnych badań RTS, S fazy 2 nie wykrywały związku między ochronną skutecznością a genetycznym podobieństwem pasożyta do 3D7 (linia konstruktów szczepionki) 30-32; jednak nasze badanie ma zarówno większą próbkę, jak i ulepszoną technologię sekwencjonowania. Sekwencjonowanie nowej generacji (Illumina MiSeq, PacBio) amplikonów reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) uzyskanych z próbek od uczestników zakażonych malarią pozwala na bardziej czułe badanie genetyczne dotyczące ochrony specyficznej dla allelu i pozwala na bardziej immunologiczną analizę wielowariantowych haplotypów . Stosując metody analizy sitowej (ryc. S1 w dodatku uzupełniającym, dostępne w pełnym tekście tego artykułu), które zostały wcześniej zastosowane do wykrywania skuteczności szczepionki przeciwko allelospecyficznym typem wirusa 1333, związek między skutecznością szczepionki, w dwóch kategoriach wiekowych w odniesieniu do dwóch zdefiniowanych punktów końcowych badania, a białkiem circumsporozoite pasożyta na trzech poziomach: cały haplotyp C-końcowego amplikonu (95 aminokwasów), zdefiniowane obszary haplotypowe C-końca ( 10 do 17 aminokwasów) i poszczególne pozycje polimorficzne. Zbadaliśmy również związek pomiędzy skutecznością szczepionki i liczbą powtórzeń NANP-NVDP, a do kontroli włączono locus antygen 2 seryny (SERA-2); SERA-2 nie było w szczepionce i dlatego nie oczekiwano różnicy skuteczności w odniesieniu do genotypu pasożyta w tym locus.
Metody
Projekt badania i generowanie danych sekwencyjnych
Rysunek 1. Continue reading „Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 ad”