Różnorodność genetyczna i skuteczność ochronna szczepionki przeciwko malarii RTS, S / AS01 cd

Analizy obejmowały dane MiSeq dla 4421 próbek C w końcowych białkach circumsporozoite i 4499 próbek SERA-2 oraz danych PacBio dla próbek NANP-NVDP z 3137 circumsporozoite (tabele od S1 do S4 i plan analizy statystycznej w dodatkowym dodatku). Wszystkie dane sekwencji amplikonu MiSeq i PacBio zostały przesłane do NCBI Sequence Read Archive35 (BioProject PRJNA235895). Przestudiuj badanie
Próba była sponsorowana przez GlaxoSmithKline Biologicals, twórcę i producenta szczepionki, i była finansowana zarówno przez GlaxoSmithKline Biologicals, jak i przez Inicjatywę Szczepień PATH, która otrzymała grant od fundacji Billa i Melindy Gates. Kilku autorów akademickich, we współpracy z czterema autorami, którzy są zatrudnieni przez GlaxoSmithKline Biologicals, zaprojektowało studium i plan analizy. Kilku autorów akademickich zebrało dane, napisało manuskrypt i ręczy za dokładność i prawdziwość zgłaszanych danych, a pierwsi i ostatni autorzy podjęli decyzję o przesłaniu rękopisu do publikacji. GlaxoSmithKline Biologicals dokonał przeglądu rękopisu przed jego przesłaniem do publikacji. Dodatkowe szczegóły dotyczące składek autorskich znajdują się w dodatkowym dodatku. Protokół badania został zatwierdzony przez wszystkie odpowiednie komisje do spraw etyki, a pisemna zgoda, wskazana za pomocą podpisu lub odcisku kciuka, została uzyskana od rodziców lub opiekunów dzieci.4-7
Analiza statystyczna
Analizy, które zostały wstępnie zdefiniowane dla tego badania, zostały opisane w planie analizy statystycznej (patrz Dodatek dodatkowy). W skrócie, wykonaliśmy analizy przesiewowe przetłumaczonych sekwencji aminokwasów, aby ocenić różnice w skuteczności szczepionki w odniesieniu do punktów końcowych pierwszych lub jedynych epizodów klinicznej malarii i pozytywności pasożyta, w zależności od tego, czy pasożyt był zgodny, czy niezgodny z 3D7. szczep szczepionkowy na białku C circumsporozoite i zgodnie z liczbą obecnych powtórzeń NANP-NVDP. Odnosi się to do zróżnicowanej skuteczności szczepionki według danej cechy pasożyta jako efektu sita . Do podstawowej analizy klinicznej malarii oceniano dwa wskaźniki skuteczności szczepionki dla poszczególnych haplotypów: skumulowana skuteczność szczepionki, która jest zdefiniowana jako jeden minus stosunek (RTS, S / AS01 vs. kontrola) skumulowanej częstości występowania pierwszego lub jedynego epizodu malarii klinicznej o określonym haplotypie przez określoną liczbę dni (t) powyżej 14 dni po trzecim szczepieniu; i skuteczność szczepionki stosunku ryzyka, która jest zdefiniowana jako jeden minus stosunek (RTS, S / AS01 vs. kontrola) chwilowych częstości występowania punktu końcowego przy założeniu, że częstości występowania (RTS, S / AS01 vs. kontrola) są proporcjonalne do czas. Do oszacowania skumulowanej skuteczności szczepionki przeciwko malarii dobranej pod względem 3D7 i niedopasowanej pod względem 3D malarii zastosowano ocenę nieparametryczną maksymalnego prawdopodobieństwa Aalen-Johansena z zastosowaniem stratyfikacji według miejsca badania, stosując testy Walda do identyfikacji niezerowej skuteczności szczepionki i efektu sito o różnej skuteczności szczepionki . Ukierunkowane oszacowanie maksymalnej wiarygodności36 zostało użyte w celu osiągnięcia tych samych celów wraz z korektą dla wszystkich istotnych wyjściowych współzmiennych uczestników (wymienionych w tabeli S5 w dodatkowym dodatku)
[podobne: pływający stolec, torbiel na kości ogonowej, pokrzywka fizykalna ]

Powiązane tematy z artykułem: pływający stolec pokrzywka fizykalna torbiel na kości ogonowej